El Banquito está lleno de vida silvestre la cual prospera gracias al aislamiento del sitio. Zorros, venados, monos y gatos salvajes merodean dentro y fuera de la selva dando oportunidad de encuentros ocasionales con los visitantes. Nubes de mariposas llenan el aire y todo tipo de aves surcan el cielo. Grupos de 50 o más pelícanos patrullan constantemente el cielo, buscando presas que algunas veces disputan con delfines apenas a metros de la playa. No es extraño observar bandadas de Coro Coro (Ibis Scarlata) volando contra el perfecto azul del cielo. La noche se puebla con miles de luciérnagas que iluminan el bosque, agregando un toque mágico a todo.
Aves: Periódicamente la Fundación Oscar Ochoa Palacios realiza un muestreo de especies. Hasta hoy se han identificado 73 diferentes especies de aves, divididas en 31 familias y 12 órdenes.
Mamíferos: Se han identificado 20 especies de mamíferos entre los que se encuentran el puma, el cunaguaro y el venado Matacán. Estas 3 especies se encuentran en peligro de extinción en muchos sitios, pero acá proliferan. También se han observado zorros, diferentes tipos de monos, marsupiales y mapaches.
Reptiles: El Banquito aloja a 29 especies de reptiles además de las tortugas marinas. Diferentes especies de iguanas, lagartijas, salamandras, morrocoyes, ranas y sapos se pueden encontrar durante todo el año. También hay pequeños caimanes en la laguna cercana a la casa. Serpientes, aunque tímidas se dejan ver de vez en cuando y algunas de ellas son venenosas, por lo que se recomienda tener siempre precaución y usar calzado apropiado.
Fauna Marina: El tipo de costa abierta y con acantilados es ideal para la proliferación de la tortuga marina. Allí hacen sus nidos y ponen sus huevos. La Fundación Oscar Ochoa Palacios junto con Procosta han implementado un programa de protección para la tortuga marina, catalogando y resguardando sus huevos, y siguiendo con detenimiento sus ciclos migratorios. Estos grupos sostienen conversaciones periódicas con los pescadores y habitantes de la zona para crear conciencia de la importancia de salvaguardar este ecosistema único.